Os comento mi problema, tengo una página web que se encarga de recibir en un servidor un archivo via ftp y necesito que en el momento que se reciba ese archivo una aplicacion ejecute unos comandos en unix, por lo que he estado leyendo en java es posible hacerlo, pero no soy capaz de hacer funcionarlo con la clase runtime, entonces me gustaria si pudierais guiarme de como hacerlo; y si fuera posible que para que se ejecuten esos comandos haya un boton en la web para iniciarlo, ya que no tendria que analizar la entrada del ftp y solo se ejecute cuando yo quiera que se haga.